La Baie de Khnifiss est un système complexe d’habitats interconnectés, comprenant la lagune de Khnifiss, les sebkhas (étendues salées) de Tazra et Mzeira, un grand lac saisonnier (daya La'wina), bordé de falaises et de dunes de sable abruptes, le lit de l’oued Awedri, normalement asséché, et le littoral marin adjacent. Les formations dunaires bloquent parfois l’écoulement de l’eau, ce qui rend les brèches rares. La lagune est très productive grâce aux remontées d’eau océanique, et abrite une flore et une faune diversifiées, dont la marmaronette marbrée (Marmaronetta angustirostris), vulnérable à l’échelle mondiale. Elle constitue également un habitat pour des oiseaux d’eau tels que le bécasseau maubèche (Calidris alba) et la barge rousse (Limosa lapponica). Le Site est une halte vitale pour les oiseaux migrateurs le long de la voie de migration Est-Atlantique. Malgré son importance écologique, la dégradation des habitats et les changements hydrologiques constituent des menaces croissantes. Le renforcement des efforts de conservation est essentiel pour préserver la biodiversité et soutenir les espèces migratrices.